vcfclick:ClickHouse + DuckDB 协作范例
vcfclick:让 VCF 回到可查询、可解释、可带走的地方如果你做过基因组分析,大概见过这样的夜晚:磁盘里躺着 VCF,终端里流着管道,脚本一层层加,最后只有作者知道哪一步在筛选。你可能是那个最后还能解释脚本的人,也可能是那个收到一份 VCF 却无法复现结果的合作者。VCF 是变异的交换格式,却常被当成分析格式。要做家系、质控、多 caller 对比,私有流程很快堆起来。Hail 一类平台能撑起人群规模,但对多数实验室偏重。vcfclick 走第三条路:把队列 VCF 落成本地可查询分析库,用 SQL 说话,并明确把两类数据交给两个引擎。ClickHouse(chDB)管队列事实,D...